PyConFr 2014

Lyon, October 25-28

PyConFR 2014

[POSTER] Science reproductible

Nicolas Rougier

Audience level:
Intermediate

Description

Un compte rendu sur une aventure e en "science reproductible" dans le domaine des neurosciences computationelles.

Abstract

Si la reproductibilité des expériences est une des propriétés fondamentales de la Science, la non-reproductibilité semble être un des marqueurs des modèles issus des neurosciences computationelles. En voulant étudier un modèle de la littérature concernant les ganglions de la base (une structure du cerveau responsable de la sélection de l'action), nous nous sommes rendus compte qu'il était presque impossible de reproduire le modèle, même après avoir lu les 6000 lignes du code original (Delphi/Pascal). Après 2 mois de réécriture intense, nous avons finalement réussi à reproduire les résultats en 200 lignes de python, simplement en se servant des outils standards.

Lien vers le poster: http://www.loria.fr/~rougier/tmp/Reproducible-Science.pdf

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